Osnovne komponente sjeckalice medicinskog otpada su komora za usitnjavanje i sustav oštrica. Komora za usitnjavanje obično je izrađena od nehrđajućeg čelika otpornog na koroziju kako bi se osiguralo da ostane nehrđala čak i nakon duljeg kontakta s medicinskim otpadom, dok njezina glatka površina olakšava čišćenje. Sustav oštrica sastoji se od oštrica izrađenih od legiranog čelika visoke čvrstoće otpornog na habanje. Ove oštrice usitnjavaju medicinski otpad velikom brzinom rotacije. Broj i raspored oštrica dizajnirani su na temelju kapaciteta obrade i učinka usitnjavanja kako bi se osiguralo ravnomjerno usitnjavanje i kontrolirana izlazna veličina čestica.
Sustav prijenosa i pogona ključan je za besprijekoran rad sjeckalice. Prijenosni sustav obično uključuje motor, reduktor i pogonsko vratilo. Motor daje snagu, a reduktor regulira brzinu, omogućujući oštricama da rade optimalnom brzinom za učinkovito usitnjavanje. Ključne komponente kao što su ležajevi i spojnice moraju biti otporne na habanje i visoke temperature kako bi se osigurala stabilnost i dugovječnost tijekom kontinuiranog rada, dok su vibracije i buka svedene na minimum.
Uništavači medicinskog otpada također su opremljeni sigurnosnim i pomoćnim sustavima. Ulaz za hranu obično je opremljen zaštitnim poklopcem ili uređajem protiv začepljenja kako bi se spriječilo rukovatelje da dodiruju oštrice; ispust je dizajniran s kontroliranim otvorom za jednostavno pražnjenje otpada i naknadnu obradu. Upravljački sustav prati opterećenje motora, radni status i zaštitu od preopterećenja; neke jedinice su također opremljene gumbom za hitno zaustavljanje kako bi se osigurala radna sigurnost. Ukupni dizajn tijela stroja uravnotežuje stabilnost s lakoćom čišćenja i održavanja, čineći opremu i učinkovitom i sigurnom.